Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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