Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg9Q9DB90 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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