Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cnot8Q9D8X5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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