Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Capns2Q9D7J7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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