Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms