Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop56Q9D6Z1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nop56Q9D6Z1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nop56Q9D6Z1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nop56Q9D6Z1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms