Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms