Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms