Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms