Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms