Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbl1Q9CWL8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms