Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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