Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms