Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrbp1Q99PL5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms