Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup155Q99P88 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup155Q99P88 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms