Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms