Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PpifQ99KR7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms