Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec3Q99J72 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms