Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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