Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin3bQ91ZU9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms