Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1bQ91YK2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms