Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpm2Q91YD4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpm2Q91YD4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms