Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Setd3Q91WC0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms