Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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