Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nae1Q8VBW6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nae1Q8VBW6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms