Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc12Q8R344 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms