Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms