Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud6bQ8K2H2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud6bQ8K2H2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms