Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms