Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms