Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep400Q8CHI8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep400Q8CHI8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms