Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Iffo1Q8BXL9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Iffo1Q8BXL9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Iffo1Q8BXL9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Iffo1Q8BXL9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Iffo1Q8BXL9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Iffo1Q8BXL9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms