Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp5Q8BKN5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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