Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms