Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms