Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pcsk9Q80W65 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcsk9Q80W65 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pcsk9Q80W65 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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