Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NischQ80TM9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NischQ80TM9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms