Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms