Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms