Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms