Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrc2bQ7TPM1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms