Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vma21Q78T54 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Vma21Q78T54 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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