Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncapd3Q6ZQK0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms