Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms