Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot1Q6ZQ08 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms