Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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