Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms