Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc154Q6RUT8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc154Q6RUT8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms