Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms