Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4Q6P1D7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms